近日，來自愛丁堡大學(xué)等機(jī)構(gòu)的一組研究人員涉及了一種新型的計(jì)算機(jī)方法來模擬癌癥進(jìn)展，相關(guān)研究或?yàn)殚_發(fā)新型癌癥選擇性療法提供一定線索。
研究者Bud Mishra教授表示，我們的工作重點(diǎn)關(guān)注多種基因和這些基因突變之間的因果關(guān)聯(lián)，隨著腫瘤環(huán)境對環(huán)境變化產(chǎn)生反應(yīng)，比如缺氧、細(xì)胞運(yùn)動或免疫反應(yīng)等，這些基因的突變就會驅(qū)動癌癥進(jìn)展。研究者希望這種新型的生物信息學(xué)工具可以幫助檢測腫瘤起源和發(fā)育過程中的規(guī)律性，而這或許對于理解不同患者機(jī)體的疾病特性非常關(guān)鍵。
相關(guān)研究發(fā)表于PNAS雜志上，研究者主要對結(jié)直腸癌進(jìn)行研究，此前研究者認(rèn)為癌癥始于“變節(jié)者”細(xì)胞及其擴(kuò)散所致，而這部分是通過細(xì)胞自發(fā)的遺傳改變的組合所引起，即癌基因發(fā)生突變，癌基因可以誘發(fā)突變，而且腫瘤抑制基因并不能有效控制這些基因的表達(dá)。近年來，科學(xué)家們利用先進(jìn)基因組測序技術(shù)揭示了癌癥生長的復(fù)雜信息，相比之前科學(xué)家們更加清晰地觀察到了腫瘤群體細(xì)胞之間的相互作用。
這項(xiàng)研究中，研究者就通過一種新型模型構(gòu)建了結(jié)直腸癌擴(kuò)散的細(xì)胞圖像，最后成功捕獲了癌細(xì)胞間的相互作用，研究者開發(fā)的這種名為Pipeline for Cancer Inference（PiCnIc，癌癥推理流水線）的模型系統(tǒng)，其會利用基因測序數(shù)據(jù)來對癌癥發(fā)生的因果關(guān)系進(jìn)行預(yù)測，即哪種情況會誘發(fā)腫瘤生長等。
為了檢測這種新型系統(tǒng)的可行性，研究者將該系統(tǒng)預(yù)測的結(jié)果同已有的關(guān)于結(jié)直腸癌生長的相關(guān)結(jié)果進(jìn)行對比，結(jié)果表明，PiCnIc系統(tǒng)可以有效地預(yù)測疾病發(fā)展的相關(guān)數(shù)據(jù)，研究者希望可以將本文研究結(jié)果同其它癌癥及療法設(shè)計(jì)的相關(guān)技術(shù)進(jìn)行結(jié)合，從而利用單分子或癌癥成像分析來改善當(dāng)前研究，最終幫助開發(fā)新型的癌癥治療方法。
原標(biāo)題：PNAS：科學(xué)家開發(fā)出新方法成功繪制出癌癥進(jìn)展
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