NfkB是一類十分重要的轉錄因子,它參與調節(jié)了細胞的炎癥反應,免疫應答,細胞增殖、分化以及存活等許多方面。同時,研究也發(fā)現(xiàn)在許多種的癌癥微環(huán)境中NF-kB的非正常表達能夠引起炎癥反應,從而促進癌癥的擴散與侵染,這說明NF-kB是聯(lián)系炎癥反應與癌癥的關鍵分子。目前有許多NF-kB的負向調節(jié)因子都被認為可能具有抑制腫瘤惡化的潛力。
長非編碼RNA(lncRNA)是一類包含大量成員的RNA家族。這一類RNA長度超過200bp,不具有翻譯成蛋白質的能力,因此得名。雖然不具有傳統(tǒng)RNA的功能,但lncRNA被發(fā)現(xiàn)具有許多調節(jié)轉錄因子活性的能力。而且許多研究證明有些lncRNA在腫瘤增殖,凋亡,擴散以及穩(wěn)態(tài)維持方面具有重要的功能。最近,中山大學中山紀念醫(yī)院乳腺癌研究中心的song erwei在Cell子刊《cancer cell》上發(fā)表了關于lncRNA調節(jié)NF-kB活性進而控制乳腺癌擴散的分子機制。
首先,作者利用乳腺癌細胞系MDA-MB-231作為研究對象分析了在TNF-a或IL-1b刺激下轉錄組的變化。結果顯示,在炎性因子刺激下,有23種lncRNA發(fā)生了上調,28種發(fā)生了下調。其中包括一種叫做NKILA的lncRNA。通過PCR的方式,作者鑒定出了NKILA是一個長度為2570nt的轉錄本。作者利用免疫原位雜交的手段發(fā)現(xiàn)NKILA主要定位于胞質中。之后,作者通過加入NF-kB入核的抑制劑Sc-3060或JSH-23來阻斷NF-kB的活性,結果顯示NF-kB的失活抑制了NKILA的上調。作者通過結合突變與染色質免疫共沉淀的手段證明了NF-kB可以作用于NKILA編碼區(qū)上游的順式調控區(qū)域。這一結果說明炎性刺激引起的NKILA上調依賴于NF-kB的活性。
之后,作者通過實驗發(fā)現(xiàn)NKILA的表達量在低擴散性的細胞系中藥遠高于在高擴散性的細胞系中。由于NF-kB能夠正向促進腫瘤的擴散,作者希望了解NKILA是否與NF-kB的活性存在反饋抑制的作用。作者通過人為抑制乳腺癌細胞中NKILA的表達水平,發(fā)現(xiàn)能夠提高NF-kB的表達量以及入核的效率。以上實驗說明NKILA是NF-KB的負向調節(jié)因子。
進一步,作者通過體外的生化試驗與熒光成像實驗證明NKILA能夠抑制Ikb在靜息狀態(tài)與激活狀態(tài)下磷酸化與降解。而這一功能依賴于它與p65-p50-IkB的相互作用。之后,作者通過一系列突變與生化實驗找到了NKILA與IKB復合體相互作用的關鍵位點:兩個RNA發(fā)卡結構。其中一個與NK-kB的DNA結合位點十分相近。
最后,作者通過體外與體內的功能學檢測分別證明了NKILA對于促進腫瘤細胞發(fā)生凋亡以及抑制腫瘤擴散的能力,并能夠顯著延長患癌小鼠的存活時間。
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