在一項(xiàng)新的研究中，來(lái)自美國(guó)布羅德研究所和哈佛大學(xué)的研究人員發(fā)現(xiàn)有證據(jù)表明使用堿基編輯器會(huì)導(dǎo)致細(xì)胞中出現(xiàn)意想不到的RNA編輯。相關(guān)研究結(jié)果發(fā)表在2019年5月8日的Science Advances期刊上，論文標(biāo)題為“Analysis and minimization of cellular RNA editing by DNA adenine base editors”。在這篇論文中，他們描述了他們對(duì)CRISPR類(lèi)型腺嘌呤堿基編輯器（ABE）的研究，以及他們?nèi)〉玫陌l(fā)現(xiàn)。

圖片來(lái)自Vossman/Wikipedia。

ABE將一個(gè)DNA堿基對(duì)轉(zhuǎn)換成另一個(gè)DNA堿基對(duì)，從而允許修復(fù)某些細(xì)胞類(lèi)型中的突變，而不會(huì)產(chǎn)生不想要的編輯效應(yīng)。據(jù)認(rèn)為，ABE還有潛力校正幾乎一半已知的導(dǎo)致醫(yī)學(xué)疾病的遺傳異常。ABE的科學(xué)基礎(chǔ)對(duì)醫(yī)學(xué)界來(lái)說(shuō)變得越來(lái)越重要。不幸的是，最近的一些研究已發(fā)現(xiàn)，ABE可能也會(huì)導(dǎo)致意料之外的編輯。在今年3月，一個(gè)研究團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)胞嘧啶堿基編輯器3型（CBE3）以高于正常的速率誘導(dǎo)單核苷酸變異。在上個(gè)月，另一個(gè)研究團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)胞嘧啶堿基編輯器（CBE）和ABE導(dǎo)致RNA中的脫靶編輯。在這項(xiàng)新的研究中，這些研究人員試圖在使用ABE時(shí)進(jìn)一步測(cè)試脫靶編輯，并在確認(rèn)后找到一種解決方案。

這些研究人員以一種包括人細(xì)胞系中所有細(xì)胞RNA轉(zhuǎn)錄本的方式分析了ABE的最新版本，稱(chēng)為ABEmax，而且他們使用比其他人使用的更靈敏的工具來(lái)做到這一點(diǎn)。他們報(bào)道他們確實(shí)在RNA樣本中發(fā)現(xiàn)了低水平的脫靶編輯。為了解決這個(gè)問(wèn)題，他們開(kāi)發(fā)了在保留在靶堿基編輯的能力同時(shí)導(dǎo)致較少RNA編輯的新型ABE變體（基于滅活的野生型大腸桿菌）。他們進(jìn)一步報(bào)道說(shuō)，這些新型變體是以一種讓RNA和DNA編輯過(guò)程解耦合的方式構(gòu)建出來(lái)的，這樣就能夠最大限度地減少DNA和RNA中的脫靶編輯。

這些研究人員得出結(jié)論：由于較低的RNA編輯且較短的RNA半衰期，對(duì)未來(lái)研究的干擾程度可能取決于它們的具體應(yīng)用。他們建議尋求讓RNA編輯最小化的科學(xué)家們使用他們構(gòu)建出的一種新變體---他們稱(chēng)之為ABEmaxQW。

參考資料：Holly A. Rees et al. Analysis and minimization of cellular RNA editing by DNA adenine base editors, Science Advances (2019). DOI: 10.1126/sciadv.aax5717.