近日，一項(xiàng)刊登在國際雜志Nature Communications上的研究報(bào)告中，來自澳大利亞加文醫(yī)學(xué)研究所的科學(xué)家們通過研究開發(fā)了一種潛在的診斷方法，其或能對癌癥樣本中的融合基因（fusion genes）進(jìn)行檢測，融合基因與五分之一的癌癥有關(guān)，同時(shí)這種新方法還能對癌癥中存在的重排DNA進(jìn)行準(zhǔn)確檢測，相比當(dāng)前方法而言，其能為癌癥患者提供更為合適的個(gè)體化治療建議。

圖片來源：Garvan Institute

我們的DNA能提供細(xì)胞維持功能的代碼，這些代碼的特定改變會驅(qū)動癌癥進(jìn)展，其中一種改變就是基因發(fā)生“融合”，當(dāng)DNA以一種特殊的方式破碎并重連時(shí)，通常來自染色體的不同DNA片段上基因會重新結(jié)合在一起；這些融合基因能產(chǎn)生編碼蛋白的異常轉(zhuǎn)錄代碼，從而促進(jìn)腫瘤形成，這種狀況估計(jì)與五分之一的人類癌癥發(fā)生直接相關(guān)。

利用標(biāo)準(zhǔn)的臨床診斷方法（比如熒光原位雜交技術(shù)（FISH）等）能對包括白血病和肉瘤等多種癌癥中的融合基因進(jìn)行篩查，研究者Jim Blackburn博士表示，用于檢測融合基因的標(biāo)準(zhǔn)FISH診斷工具已經(jīng)在臨床上使用了大約30年，但每一個(gè)測試只能夠提供關(guān)于一個(gè)融合基因的檢測結(jié)果，無法給出完整的融合基因的檢測情況；當(dāng)前的方法往往無法檢測一些不常見的融合基因。

這項(xiàng)研究中，研究者所使用的新方法能夠抹去癌癥在哪里被發(fā)現(xiàn)的相關(guān)信息，他們會從更廣泛的角度來研究已知的與所有癌癥亞型融合有關(guān)的基因，為了開發(fā)這種新方法，研究者調(diào)查了是否對癌細(xì)胞的RNA進(jìn)行測序就能夠提供比FISH技術(shù)更加準(zhǔn)確的融合基因信息，隨后研究者設(shè)計(jì)出了兩種更為廣泛檢測盤來作為工具幫助篩選已知所有融合基因的RNA，其中一種檢測盤應(yīng)用于血液癌癥，另一種則用于實(shí)體瘤。

研究者利用臨床癌癥患者樣本驗(yàn)證了這種新方法，他們發(fā)現(xiàn)，對RNA的分析不僅能夠準(zhǔn)確檢測到FISH技術(shù)所鑒別出的融合基因，還能夠鑒別出FISH技術(shù)無法識別到的超過20%的融合基因。研究者希望這兩種診斷技術(shù)能夠更好地幫助診斷癌癥中的融合基因。如今科學(xué)家們已經(jīng)開發(fā)出了針對某些融合基因的靶向性療法，一個(gè)典型例子就是抗癌藥物larotrectinib，其能降低NTRK基因與其伴侶基因融合后編碼的過度反應(yīng)酶類的活性，指定特殊的癌癥療法需要識別出正確的融合基因。

后期研究人員還將進(jìn)行更為深入的研究鑒別出更多的融合基因，從而幫助更加準(zhǔn)確地對患者進(jìn)行高效診斷，并為其提供新型的個(gè)體化療法。

原始出處：Heyer EE, Deveson IW, Wooi D, et al. Diagnosis of fusion genes using targeted RNA sequencing. Nat Commun. 2019 Mar 27;10(1):1388. doi: 10.1038/s41467-019-09374-9.

原標(biāo)題：Nat Commun：開發(fā)出一種高效診斷多種癌癥亞型的新技術(shù)